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Paroi cellulaire microbienne : le « code-barres » de la interaction plante – pathogène

Les plantes, même si elles ne disposent pas d’un système immunitaire mobile comme celui des animaux, ont développé des mécanismes extrêmement sophistiqués pour se défendre contre les micro-organismes. Un aspect central de cette défense est sa capacité à reconnaître des composants spécifiques dans la paroi cellulaire des champignons et des bactéries. Ces molécules, telles que la chitine et le peptidoglycane, servent non seulement d'éléments constitutifs des parois cellulaires microbiennes, mais agissent également comme des « codes-barres » que les plantes peuvent « lire » pour identifier si un micro-organisme est un pathogène ou un symbiote inoffensif. Incroyable, non ? Restez à l'écoute car nous allons vous le dire.





# # # Mécanismes de défense des plantes # # #

La première chose que nous allons faire est de parler un peu de ce que la plante reconnaît et comment. La plante n'a pas de système immunitaire comme les animaux mais elle possède un grand nombre de sentinelles qui surveillent tout ce qui pénètre dans la plante. Qui sont les sentinelles de la plante :

  • Récepteurs : sont des protéines ancrées dans la paroi des cellules végétales qui sont chargées de reconnaître des fragments des composants de la paroi cellulaire fongique, comme le glucane et la chitine. L'un des récepteurs les plus étudiés est CERK1, responsable de la détection de la chitine. Une fois reconnus, ces fragments déclenchent la réponse de défense de la plante.

  • Enzymes : Au sein des enzymes, on trouve des enzymes dégradantes telles que les glucanases et les chitinases dont la fonction est de couper des fragments de la paroi végétale afin qu'ils soient reconnus par les récepteurs. Il existe également un groupe de protéines qui agissent comme une balayeuse, collectant de petits morceaux de chitine et les amenant vers les récepteurs pour activer les défenses.




Schéma de reconnaissance de la chitine fongique dans la plante. 1 : Chitine, 2 : chitosane, 3 : protéines qui captent les morceaux de chitine et les acheminent vers les récepteurs, 4 : récepteurs végétaux, 5 : chitinases végétales
1 : Chitine, 2 : chitosane, 3 : protéines qui captent les morceaux de chitine et les acheminent vers les récepteurs, 4 : récepteurs végétaux, 5 : chitinases végétales

Une fois que les mécanismes de défense de la plante sont activés, une cascade de signaux commence qui provoque l'accumulation de composés au site d'entrée de l'agent pathogène qui agira comme du ciment, essayant d'arrêter l'entrée (comme la callose et la lignine) et de composés toxiques comme ceux-ci. comme espèces réactives de l’oxygène (RO). Et dans les cas extrêmes, l’apoptose, qui est la mort programmée des cellules attaquées et des cellules environnantes, voire de grandes régions de tissus végétaux.



Image de microscopie confocale laser d’une tache de callose. La queue est jaune (flèche) aux sites d'entrée de l'agent pathogène (pointe de flèche).
Image de fluorescence d'une accumulation de callose qui apparaît en jaune (flèche) aux sites d'entrée du champignon (triangle)


# # # Chitine dans les champignons : reconnaître les amis et les ennemis # # #

La chitine est présente dans tous les champignons. Il s'agit d'un polymère composé d'unités N-acétylglucosamine et constitue un composant clé de la paroi cellulaire fongique. Pour que les plantes puissent identifier la présence d’un champignon, elles doivent être capables de détecter les fragments de chitine libérés lorsque le champignon tente d’envahir les tissus végétaux.



Mais tous les fragments de chitine ne sont pas identiques. La désacétylation est un processus par lequel les groupes acétyle (un groupe dérivé de l'acide acétique) sont éliminés de la chitine, la convertissant en chitosane, une molécule beaucoup moins visible pour les défenses des plantes. Ce processus a un effet direct sur la façon dont la plante perçoit un champignon.


Élimination du groupe acétyle de la chitine par l'enzyme chitine désacétylase, la convertissant en chitosane
Modification de la chitine en chitosane par l'enzyme chitine désacétylase

  1. Teneur élevée en chitosane et symbiose : Les champignons qui forment des relations symbiotiques avec les plantes, tels que les mycorhizes, ont souvent une chitine hautement désacétylée, c'est-à-dire qu'ils ont une teneur élevée en chitosane. Le chitosane est moins détectable par les récepteurs de chitine des plantes, ce qui permet au champignon de coexister avec la plante sans déclencher une forte réponse immunitaire. Dans ce contexte, la désacétylation de la chitine agit comme un « code barre » qui signale à la plante que le champignon est inoffensif et bénéfique.


  2. Faible teneur en chitosane et pathogénicité : D'autre part, les champignons pathogènes ont généralement de la chitine avec un degré de désacétylation plus faible, c'est-à-dire une quantité plus faible de chitosane, de sorte que cette chitine est plus facilement reconnue par les récepteurs végétaux, ce qui conduit à l'activation de une réponse immunitaire défensive. La plante « lit » cette quantité de chitosane comme un signal de danger et réagit en conséquence pour tenter d’arrêter l’invasion fongique.



La question est la suivante : si la paroi de tous les champignons contient de la chitine, pourquoi la plante ne se défend-elle pas contre les agents symbiotiques ? Ici, le modèle chitine – chitosane entre en jeu.



# # # Le motif chitine-chitosane : un code-barres moléculaire # # #

Non seulement la quantité de chitosane est cruciale, mais également la structure chitine-chitosane. Ce motif, qui fait référence à la disposition spécifique du chitosane le long de la chaîne de chitine, agit comme un « code-barres » très spécifique que les plantes peuvent « lire ». En fonction de ce schéma, la plante peut faire la différence entre un champignon pathogène et un champignon symbiotique inoffensif.

 

  • Motifs complexes et symbiotes : Les champignons symbiotiques ont tendance à avoir des motifs de chitosane plus complexes et distribués, ce qui rend la détection par les récepteurs végétaux difficile. Ce schéma complexe envoie un signal indiquant que le champignon est inoffensif, voire bénéfique, permettant ainsi une relation symbiotique réussie.

 

  • Motifs simples et pathogènes : En revanche, les champignons pathogènes ont généralement des motifs de chitosane plus simples et plus prévisibles, ce qui les rend plus faciles à détecter par les récepteurs immunitaires des plantes. Cela déclenche une réponse immunitaire visant à éliminer la menace.

 

 


# # # Les agents pathogènes trompent la plante Comment ? # # #

Tout comme les plantes reconnaissent un schéma dans la chitine – chitosane pour identifier d’éventuels agents pathogènes, les agents pathogènes en ont tiré des leçons et se déguisent en gentils. Oui, vous avez bien lu, ils se déguisent en bons. Les agents pathogènes ont développé des stratégies pour cacher ou modifier la chitine de leur paroi, et leur survie dépend de leur réussite.


Un exemple se trouve dans plusieurs articles scientifiques où ils ont vérifié le rôle que joue la modification de la chitine en chitosane dans le développement de l'infection chez certains pathogènes. C'est le cas de l'oïdium, un groupe de champignons qui ne vivent que de tissus végétaux vivants et dont la survie dépend de leur capacité à se cacher des défenses de la plante. Lors de travaux récents, la capacité du champignon à convertir la chitine en chitosane a été bloquée. Et SURPRISE ! Le résultat est incroyable, la plante passe de la non-détection du pathogène à sa détection, activant ses défenses et arrêtant complètement l'infection. Seul le schéma chitine-chitosane a été modifié, et ainsi le déguisement de l'agent pathogène a été supprimé.



Image d’une tache d’espèce réactive de l’oxygène. a, Infection fongique normale (flèches blanches). b, l'infection est stoppée par la plante (carrés rouges) chez les champignons ayant bloqué la désacétylation de la chitine
a, Infection fongique normale (flèches blanches). b, l'infection est stoppée par la plante (carrés rouges) chez les champignons ayant bloqué la désacétylation de la chitine



Si vous souhaitez en savoir plus sur la façon dont les pathogènes se cachent des défenses des plantes, voici cet article de notre blog où nous vous expliquons les différentes stratégies utilisées par les pathogènes. Blog : Le cheval de Troie microbien


# # # Comment débloquer un mobile # # #

Le concept selon lequel les plantes « lisent » ces schémas de désacétylation peut être comparé au déverrouillage d’un téléphone portable à l’aide d’une empreinte digitale. Si le mobile ne reconnaît pas l'empreinte digitale, celle-ci est bloquée, en supposant qu'un éventuel intrus tente d'y accéder. Cependant, lorsqu'il détecte votre empreinte digitale, il vous permet d'entrer sans problème. De même, si une plante détecte un motif chitine-chitosane qu’elle ne reconnaît pas (comme un simple motif chez un champignon pathogène), elle active ses défenses pour bloquer l’intrus. En revanche, s’il reconnaît un schéma connu et bénin (comme le schéma complexe d’un symbiote), il permet l’interaction sans activer ses défenses.




# # # Peptidoglycane dans les bactéries : un mécanisme similaire # # #

Le peptidoglycane est un composant fondamental de la paroi cellulaire des bactéries, en particulier des bactéries à Gram positif. Il est constitué de chaînes de sucres aminés et de peptides qui assurent la rigidité et protègent la cellule bactérienne. Semblable à la chitine des champignons, le peptidoglycane peut également être modifié chimiquement, et ces modifications ont un impact direct sur la façon dont la plante perçoit la bactérie.

 

  • Modifications du peptidoglycane : les bactéries peuvent modifier le peptidoglycane par le biais de processus tels que la désacétylation et la méthylation, qui modifient la structure chimique de la molécule. Ces modifications peuvent rendre le peptidoglycane moins visible pour les récepteurs immunitaires de la plante, permettant ainsi à la bactérie d'éviter une forte réponse immunitaire.

 

  • Reconnaissance et réponse immunitaire : Lorsque le peptidoglycane est non modifié ou moins modifié, il est plus susceptible d'être reconnu par les récepteurs végétaux, activant ainsi une réponse immunitaire défensive. En revanche, les modifications qui masquent le peptidoglycane peuvent inciter la plante à ne pas détecter la bactérie comme une menace, facilitant ainsi l'infection ou permettant une coexistence pacifique.




# # # Le « code-barres » moléculaire : une stratégie évolutive # # #

Le concept de « code-barres » moléculaire est une métaphore utile pour décrire comment les plantes font la distinction entre les micro-organismes pathogènes et symbiotiques. Le motif de désacétylation de la chitine des champignons et les modifications du peptidoglycane des bactéries sont des stratégies évolutives que ces micro-organismes ont développées pour interagir avec leurs hôtes végétaux.

 

  • Evolution des modifications : Les champignons et les bactéries ont évolué pour modifier leurs parois cellulaires de manière à influencer la façon dont ils sont perçus par les plantes. Les champignons symbiotiques, par exemple, ont développé des niveaux élevés de désacétylation de leur chitine afin d'éviter d'être détectés comme agents pathogènes. De même, les bactéries symbiotiques peuvent modifier leur peptidoglycane pour éviter d'être détectées ou pour minimiser la réponse immunitaire de la plante.

 

  • Diversité des réponses chez les plantes : Les plantes, pour leur part, ont développé un large éventail de récepteurs capables de détecter différents motif moléculaires chez les micro-organismes. Cela leur permet d’ajuster leur réponse immunitaire en fonction du type de micro-organisme qu’ils rencontrent, soit en activant de fortes défenses contre les agents pathogènes, soit en favorisant la tolérance et la symbiose avec des micro-organismes bénéfiques.

 

 

 

# # # Implications pour l'agriculture et la biotechnologie # # #

Comprendre comment les plantes « lisent » ces codes moléculaires a d’énormes implications pour l’agriculture. Si la biotechnologie pouvait manipuler ces mécanismes, il serait possible de développer des cultures plus résistantes aux maladies ou bénéficiant davantage de relations symbiotiques avec les micro-organismes.

 

  1. Cultures résistantes aux maladies : En sélectionnant ou en modifiant génétiquement des plantes capables de reconnaître plus efficacement les motifs de désacétylation de la chitine et les modifications du peptidoglycane, nous pourrions développer des cultures plus résistantes aux infections par des champignons et des bactéries pathogènes.


  2. Exploiter les symbiotes bénéfiques : D'un autre côté, en favorisant l'interaction avec les champignons et les bactéries dotés de « codes-barres » bénéfiques, nous pourrions améliorer l'absorption des nutriments et la santé générale des plantes, réduisant ainsi le besoin d'engrais et d'autres intrants chimiques.

 

 

L’étude de la façon dont les plantes reconnaissent et réagissent aux modifications de la chitine et du peptidoglycane des micro-organismes, et finalement de la paroi cellulaire, nous offre une fenêtre fascinante sur l’interaction complexe entre les plantes et les micro-organismes. Ces « codes-barres » moléculaires sont essentiels à la survie des plantes, et leur compréhension pourrait révolutionner l’agriculture, permettant de cultiver des plantes plus résistantes et plus efficaces et de développer des traitements plus spécifiques et plus respectueux de l’environnement.




Nous vous laissons ces articles de blog au cas où vous seriez plus curieux de connaître ce sujet


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